Doctorant F/H Amélioration des images CBCT pour l'électroporation irréversible des tumeurs par modélisation et compensation des artefacts métalliques et de diffraction
Contract type : Fixed-term contract
Level of qualifications required : Graduate degree or equivalent
Fonction : PhD Position
Level of experience : Recently graduated
About the research centre or Inria department
Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et compte une vingtaine d’équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences numériques. Il est au cœur d'un riche écosystème de R&D et d’innovation : PME fortement innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l’enseignement supérieur, laboratoires d'excellence, institut de recherche technologique…
Context
Le projet de thèse se déroule au sein de l'équipe MONC (INRIA Bordeaux Sud-Ouest), dans un environnement scientifique pluridisciplinaire combinant mathématiques, traitement d'image, ingénierie et médecine. L'objectif est d'améliorer la qualité des images CBCT (Cone Beam Computed Tomography) utilisées pour l'électroporation irréversible des tumeurs, en modélisant et en compensant les artefacts métalliques et de diffraction.
Les atouts du poste:
- Impact direct: Participation à une innovation technologique majeure dans le traitement du cancer.
- Environnement stimulant: Collaboration avec des experts en mathématiques, médecine et ingénierie.
- Visibilité scientifique: Opportunités de publications et de communications dans des conférences de haut niveau en traitement d'image médical.
Assignment
Vous contribuerez à la conception, l'implémentation et l'évaluation d'algorithmes de reconstruction CBCT robustes aux artefacts métalliques et de diffraction, dans un contexte clinique contraint.
Vos missions principales incluront:
- Identification des sources d'artefacts dans les CBCT à faible nombre de projections.
- Modélisation physique et numérique des phénomènes de diffraction liés aux aiguilles d'électroporation.
- Exploitation des données dentaires fournies par Acteon pour modéliser des géométries métalliques complexes.
- Développement et optimisation d'opérateurs de suppression d'artefacts.
- Validation quantitative et qualitative des algorithmes avec les partenaires cliniques.
Main activities
- Revue de littérature sur la reconstruction CBCT, les artefacts métalliques et les modèles physiques associés.
- Programmation d'algorithmes en Python (et C++ si besoin).
- Utilisation de bibliothèques de traitement d'image et de deep learning (PyTorch, SimpleITK, ODL, etc.).
- Validation expérimentale sur des données simulées et réelles.
- Communication scientifique via publications, présentations en conférences, etc.
Skills
Compétences techniques:
- Indispensables: Programmation Python, traitement d'images, reconstruction tomographique, apprentissage automatique.
- Souhaitées: Connaissances en C++, physique des rayons X, modélisation des interactions matière-rayonnement, artefacts CBCT.
Qualités personnelles:
- Curiosité scientifique.
- Sens du travail en équipe.
- Autonomie et bonne organisation.
Profil académique:
- Master 2 ou équivalent en traitement du signal, mathématiques appliquées, physique médicale ou équivalent.
- Une première expérience en imagerie médicale (stage ou projet) serait un plus.
Benefits package
- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
- Sécurité sociale
Remuneration
Le salaire sera de 2200€ brut, puis 2300€ brut à partir de 2026
General Information
- Theme/Domain :
Modeling and Control for Life Sciences
Scientific computing (BAP E) - Town/city : Talence
- Inria Center : Centre Inria de l'université de Bordeaux
- Starting date : 2025-10-01
- Duration of contract : 3 years
- Deadline to apply : 2025-07-31
Warning : you must enter your e-mail address in order to save your application to Inria. Applications must be submitted online on the Inria website. Processing of applications sent from other channels is not guaranteed.
Instruction to apply
Si vous êtes intéressé.es par cette offre, merci de bien vouloir candidater via le site jobs.inria avec les éléments suivants :
- cv
- lettre de motivation
- lettre de recommandation
Defence Security :
This position is likely to be situated in a restricted area (ZRR), as defined in Decree No. 2011-1425 relating to the protection of national scientific and technical potential (PPST).Authorisation to enter an area is granted by the director of the unit, following a favourable Ministerial decision, as defined in the decree of 3 July 2012 relating to the PPST. An unfavourable Ministerial decision in respect of a position situated in a ZRR would result in the cancellation of the appointment.
Recruitment Policy :
As part of its diversity policy, all Inria positions are accessible to people with disabilities.
Contacts
- Inria Team : MONC
-
PhD Supervisor :
Denis De Senneville Baudouin / baudouin.denis-de-senneville@inria.fr
The keys to success
Profil recherché:
- Curieux(se) et passionné(e) par l'innovation à fort impact médical.
- Capacité à travailler à l'interface entre médecine, mathématiques appliquées et technologie.
- À l'aise dans un cadre collaboratif, avec interactions régulières avec des partenaires industriels et cliniques.
Points forts attendus:
- Solides bases en traitement/reconstruction d'images.
- Compétences en programmation scientifique (Python, PyTorch).
- Intérêt pour la modélisation mathématique et les problèmes inverses.
Qualités personnelles:
- Esprit rigoureux et structuré.
- Créativité et capacité à innover.
- Adaptabilité dans un environnement interdisciplinaire.
- Capacité de vulgarisation et de communication claire des résultats.
About Inria
Inria is the French national research institute dedicated to digital science and technology. It employs 2,600 people. Its 200 agile project teams, generally run jointly with academic partners, include more than 3,500 scientists and engineers working to meet the challenges of digital technology, often at the interface with other disciplines. The Institute also employs numerous talents in over forty different professions. 900 research support staff contribute to the preparation and development of scientific and entrepreneurial projects that have a worldwide impact.