Post-Doctorant F/H Recalage de volumes anatomiques pour la segmentation et la réduction de fractures osseuses
Contract type : Fixed-term contract
Level of qualifications required : PhD or equivalent
Fonction : Post-Doctoral Research Visit
Level of experience : Recently graduated
Context
L’objectif est de réaliser un travail post-doctoral autour du recalage de formes 3D, avec des applications en imagerie médicale et tout particulièrement à l'analyse de fractures multiples.
Assignment
Missions :
Le recalage de formes est une tâche fondamentale en anatomie numérique, et plus généralement en imagerie. La grande majorité des méthodes utilisées pour résoudre ce problème reposent sur un a priori de régularité de la déformation entre image source et image cible, imposé de manière explicite pour les approches classiques et implicite pour les méthodes d’apprentissage profond. Ce choix de modélisation arrive à ses limites lorsque les images présentent de violentes anomalies qui ne peuvent s’expliquer par de simples déformations élastiques : fractures, tumeurs, ischémies, etc.
Nous proposons de dépasser ce problème en approfondissant l’étude de méthodes de recalage reposant sur des “features” de grande dimension (“functional maps”) pour les rendre robustes aux déchirures et à la disparition de certaines pièces du "puzzle" anatomique. Il s’agira d’opérer une synthèse entre des méthodes développées dans les communautés du graphisme par ordinateur et de l’imagerie médicale.
Au point de vue mathématique, ce projet s’inscrit dans la dynamique parisienne autour de l’analyse de formes à laquelle Jean Feydy contribue depuis 2015. Au point de vue médical, ce travail s’insère dans le projet de recherche hospitalo-universitaire (RHU) REBONE sur l’analyse de fractures multiples (2024-29, 25M€). Nos données proviendront de l’hôpital Pasteur à Nice et de l’hôpital Cochin à Paris, avec qui l’équipe HeKA entretient des liens étroits.
Main activities
Principales activés :
-
Travailler sur le développement rapide de méthodes de recalage de formes 3D.
-
Etudier la robustesse des méthodes de functional maps aux artefacts topologiques.
-
Appliquer ces travaux à des images 3D de fractures multiples du bassin, poignet et tibia.
Skills
Compétences techniques et niveau requis : Thèse en informatique ou mathématiques appliquées.
Langues : Français, Anglais.
Benefits package
- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail (après 12 mois d'ancienneté)
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
- Sécurité sociale
General Information
- Theme/Domain :
Computational Neuroscience and Medicine
Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre (BAP A) - Town/city : Paris
- Inria Center : Centre Inria de Paris
- Starting date : 2024-10-07
- Duration of contract : 12 months
- Deadline to apply : 2024-08-31
Warning : you must enter your e-mail address in order to save your application to Inria. Applications must be submitted online on the Inria website. Processing of applications sent from other channels is not guaranteed.
Instruction to apply
Defence Security :
This position is likely to be situated in a restricted area (ZRR), as defined in Decree No. 2011-1425 relating to the protection of national scientific and technical potential (PPST).Authorisation to enter an area is granted by the director of the unit, following a favourable Ministerial decision, as defined in the decree of 3 July 2012 relating to the PPST. An unfavourable Ministerial decision in respect of a position situated in a ZRR would result in the cancellation of the appointment.
Recruitment Policy :
As part of its diversity policy, all Inria positions are accessible to people with disabilities.
Contacts
- Inria Team : HEKA
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Recruiter :
Feydy Jean / jean.feydy@inria.fr
The keys to success
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Une formation solide en mathématiques appliquées.
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Un goût pour le développement logiciel et le calcul scientifique.
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Un intérêt sincère pour les applications cliniques et le monde de la santé.
About Inria
Inria is the French national research institute dedicated to digital science and technology. It employs 2,600 people. Its 200 agile project teams, generally run jointly with academic partners, include more than 3,500 scientists and engineers working to meet the challenges of digital technology, often at the interface with other disciplines. The Institute also employs numerous talents in over forty different professions. 900 research support staff contribute to the preparation and development of scientific and entrepreneurial projects that have a worldwide impact.