Post-Doctorant F/H Recalage de volumes anatomiques pour la segmentation et la réduction de fractures osseuses

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Type de contrat : CDD

Niveau de diplôme exigé : Thèse ou équivalent

Fonction : Post-Doctorant

Niveau d'expérience souhaité : Jeune diplômé

Contexte et atouts du poste

L’objectif est de réaliser un travail post-doctoral autour du recalage de formes 3D, avec des applications en imagerie médicale et tout particulièrement à l'analyse de fractures multiples.

Mission confiée

Missions :
Le recalage de formes est une tâche fondamentale en anatomie numérique, et plus généralement en imagerie. La grande majorité des méthodes utilisées pour résoudre ce problème reposent sur un a priori de régularité de la déformation entre image source et image cible, imposé de manière explicite pour les approches classiques et implicite pour les méthodes d’apprentissage profond. Ce choix de modélisation arrive à ses limites lorsque les images présentent de violentes anomalies qui ne peuvent s’expliquer par de simples déformations élastiques : fractures, tumeurs, ischémies, etc.

Nous proposons de dépasser ce problème en approfondissant l’étude de méthodes de recalage reposant sur des “features” de grande dimension (“functional maps”) pour les rendre robustes aux déchirures et à la disparition de certaines pièces du "puzzle" anatomique. Il s’agira d’opérer une synthèse entre des méthodes développées dans les communautés du graphisme par ordinateur et de l’imagerie médicale.

Au point de vue mathématique, ce projet s’inscrit dans la dynamique parisienne autour de l’analyse de formes à laquelle Jean Feydy contribue depuis 2015. Au point de vue médical, ce travail s’insère dans le projet de recherche hospitalo-universitaire (RHU) REBONE sur l’analyse de fractures multiples (2024-29, 25M€). Nos données proviendront de l’hôpital Pasteur à Nice et de l’hôpital Cochin à Paris, avec qui l’équipe HeKA entretient des liens étroits.

Principales activités

Principales activés :

  • Travailler sur le développement rapide de méthodes de recalage de formes 3D.

  • Etudier la robustesse des méthodes de functional maps aux artefacts topologiques.

  • Appliquer ces travaux à des images 3D de fractures multiples du bassin, poignet et tibia.

 

Compétences

Compétences techniques et niveau requis : Thèse en informatique ou mathématiques appliquées.

Langues : Français, Anglais.

Avantages

  • Restauration subventionnée
  • Transports publics remboursés partiellement
  • Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
  • Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail (après 12 mois d'ancienneté)
  • Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
  • Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
  • Accès à la formation professionnelle
  • Sécurité sociale