2022-05400 - Post-Doctorant F/H Découverte de sous-groupes de répondeurs aux combinaisons de chimiothérapies

Type de contrat : CDD

Contrat renouvelable : Oui

Niveau de diplôme exigé : Thèse ou équivalent

Fonction : Post-Doctorant

Contexte et atouts du poste

Dans le cadre du projet CombO en lien avec le Health Data Hub et le Centre Léon Bérard (CLB) de Lyon, nous cherchons une postdoc pour un contrat de 2 ans. 

Lea postdoc fera partie de l’équipe HeKA (Inria, Inserm, Univ. Paris Cité, https://team.inria.fr/heka/fr/) et sera localisée à Paris, in PariSanté Campus (https://parisantecampus.fr/, https://goo.gl/maps/eW55zuHd2ggt2Q4Z9).

Des déplacements réguliers au CLB de Lyon sont à prévoir (frais pris en charge).

Le postdoc sera employé par Inria Paris et suivra pour cette raison la grille de salaire Inria.

Mission confiée

Le projet de recherche du postdoc concerne l’extraction de connaissances à partir de données de santé, et plus particulièrement la recherche de sous-groupes de patients qui répondent de façon homogène aux combinaisons de chimiothérapie.

La mission du postdoc débutera par une phase de préparation de données, incluant l’extraction de marqueurs de réponse et de descripteurs à partir des notes cliniques de dossiers patients informatisés, la liaison de données cliniques et génétiques des patients avec les graphes de connaissances et ontologies de domaines. 

Il s’agit ensuite d’explorer les méthodes de découverte de sous-groupes afin de mettre en évidence des ensembles de patients répondant différemment aux différentes combinaisons de molécules chimiothérapiques.

Principales activités

Voir la description de la mission. 

Compétences

Compétences appréciées : 

Extraction de connaissances, fouille de texte, approches non-supervisées, découverte de sous-groupes, données de santé, graphes de connaissances

Python, spaCy, RDF, Sparql

Avantages

  • Restauration subventionnée
  • Transports publics remboursés partiellement
  • Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
  • Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
  • Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
  • Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
  • Accès à la formation professionnelle